亚马孙雨林由于大规模开发，商业性伐木及无序盗伐、毁林开垦荒地、安置移民盖房、修路、采矿、兴建水电站等活动致使雨林面积不断退缩，雨林生态系统恶化，保护雨林已到刻不容缓地步。目前保护亚马孙雨林已成为巴西、秘鲁等国和全世界的共识，采取了划定“印第安人保护区”、国家公园、森林公园等保护区，自然保护区内严禁进行垦荒、盗伐林木、捕获野生动物；加强对亚马孙雨林的监管，对给雨林带来严重灾难的不法行为给予严厉制裁；亚马孙流域各国与联合国相关组织提出一项全球行动计划——减少砍伐森林和森林退化导致的温室气体排放。巴西在1988年颁布的新宪法中，规定“亚马孙地区是国家遗产”，提出了巴西政府和公民在保护环境方面的权利和义务。巴西政府对保护亚马孙雨林高度重视，投入大量资金用于雨林的保护，1991年—2002年间政府为保护亚马孙雨林生态和自然资源累积投入1000亿美元。巴西国家林业发展局制订了相关的法律法规，建设了一支专事森林管理、执法的森林警察队伍。建设大型水电工程，都要考虑对生态破坏的补偿，对水库淹没区域森林进行抢救性移植、搬迁，对水库淹没区的印第安人进行妥善安置，给予经济补偿。

20世纪60年代，为开发亚马孙地区丰富资源，解决巴西经济发展严重不均衡问题，巴西政府制定了《巴西国土整治规划》，成立了“亚马孙地区开发管理委员会”，开始了亚马孙地区的大开发。巴西的亚马孙地区是指巴西北部的亚马孙州、帕拉州、马托格罗索州、阿马帕州、罗赖马州、朗多尼亚州、阿里克州等七个州，绝大部分处于亚马孙河流域，土地面积约占巴西的40%。